Zoznam vyšetrení:
Vyšetrenia
Hereditárna forma karcinómu prsníka/vaječníkov (HBOC, gény BRCA1, BRCA2, vyšetrenie pomocou MLPA)
Dedičná, alebo hereditárna forma karcinómu prsníka a vaječníkov predstavuje okolo 10% zo všetkých diagnostikovaných karcinómov prsníka a vaječníkov. Tento genetický onkologický syndróm sa vyznačuje konkrétnymi vlastnosťami, ktoré vychádzajú z dedičnej povahy ochorenia. Všeobecne môžeme povedať, že ide o charakteristiky jednak zvýšeného počtu karcinómov prsníka alebo vaječníkov v rámci rodiny, často v niekoľkých generáciách. Druhým typickým znakom je nízky vek nástupu ochorenia, t.j. diagnostikovanie ochorenia v predmenopauzálnom veku, okolo 40-50 rokov. Genetickým vyšetrením dokazujeme prítomnosť porúch (mutácií) v génoch BRCA1 (24 exónov) a BRCA2 (27 exónov). Tieto mutácie majú za následok nefunkčnosť alebo nedostatočnú funkčnosť niektorého z uvedených génov, pričom tieto sú dôležité v niekoľkých bunkových procesoch, najmä však opravách poškodenej DNA. Primárne prebieha analýza génu BRCA1, pričom následne po negatívnom výsledku nasleduje analýza génu BRCA2, prípadne ešte i MLPA analýza oboch génov (táto prebieha pri oboch génoch naraz).
Pre realizáciu tohto špeciálneho genetického vyšetrenia je nutné splniť niekoľko podmienok:
a.) absolvovať genetickú konzultáciu u klinického genetika (zoznam ambulancií TU)
b.) spĺňať indikačné kritériá
c.) genetické vyšetrenie začína od žijúceho pacienta
Dĺžka vyšetrenia: Vyšetrenie vzorky DNA od jednej pacientky trvá v závislosti od rozsahu ponúkaného vyšetrenia (exóny 2, 3, 5, 11, 13, 16, 18, 20) približne 3 mesiace/1 gén. Čakacie doby od príjmu vzorky po ukončenie analýzy sú približne 1 rok/1 gén.
V prípade cieleného vyšetrenia prítomnosti už známej patologickej mutácie v rámci rodiny trvá približne 1 mesiac, pričom vzorka je analyzovaná ihneď po príjme.
Materiál na vyšetrenie, transport: Do skúmavky typu Vacutainer s EDTA (ružový vrchnák, ako na krvný obraz) sa odoberie 1 ml periférnej krvi. Vzorka sa následne označí menom, rokom narodenia pacienta a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na adresu OLG ÚLVM, OÚSA. Odber nemusí byť realizovaný nalačno.
Pri vzorkách určených na DNA analýzu sa periférna krv môže bez zmeny kvality DNA transportovať 1 až 2 dni, príp. aj poštou, avšak vzorka musí byť dostatočne zabezpečená proti poškodeniu, resp. vyliatiu a znehodnoteniu. V prípade zmrazenia vzorky periférnej krvi sa vzorka následne skladuje a transportuje výlučne zmrazená pri -15°C v mraziacom boxe až do izolácie DNA.
Indikačné kritériá na vyšetrenie: Vyšetrenie začína od žijúceho postihnutého pacienta.
1. Traja pokrvní príbuzní postihnutí karcinómom prsníka alebo vaječníka, pričom aspoň v jednom prípade ochorenie diagnostikované do 50 rokov.
2. Dvaja príbuzní (I. stupňa) s karcinómom prsníka alebo vaječníka:
- ak sú obidvaja pod 50 r.
- ak je jeden muž
- ak je jeden s bilaterálnou alebo duplexnou formou ochorenia
- ak je jeden pod 50 r. a ďalší príbuzný (I. st.) má nádorové ochorenie zo spektra HBOC
3. Jeden postihnutý s bilaterálnou formou karcinómu prsníkov alebo vaječníkov alebo duplexnou formou ochorenia, pričom výskyt prvého ochorenia je do 50 rokov.
4. Jeden postihnutý s karcinómom prsníka - muž.
5. Jeden postihnutý s karcinómom prsníka alebo vaječníka do veku 35 rokov.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 1 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dedičná forma medulárneho karcinómu štítnej žľazy (MEN 2, gén RET)
Mnohopočetnú endokrinnu neopláziu typu II (MEN2) možno charakterizovať ako zriedkavé dedičné ochorenie sprevádzané výskytom medulárneho karcinómu štítnej žľazy, unilaterálnymi a bilaterálnymi feochromocytmi (PHEO) a inými typmi hyperplázií a/ alebo neoplázií endokrinných tkanív u jedného pacienta. Rozoznávame sporadickú (náhodne sa vyskytujúcu) a familiárnu formu uvedeného syndrómu (výskyt daného ochorenia v rodine u prvostupňových a druhostupňových príbuzných). MEN2 syndróm zahŕňa 3 podtypy a to: MEN2A, MEN2B (najagresívnejší podtyp) a Familiárny medulárny karcinóm štítnej žľazy (FMTC), pričom na MEN2A pripadá viac ako 80% všetkých prípadov MEN2.
MEN2 syndróm je asociovaný s aktivačnou mutáciou v géne RET. Uvedený gén má 20 exónov a kóduje transmembránový proteín- tyrosín kinázový receptor, ktorý má úlohu v dôležitých bunkových prosecoch ako je napr. proliferácia, diferenciácia a bunkový transport. Mutácie v géne RET majú za následok neustálu aktivitu spomínaných procesov v bunkách.
Doterajšie štúdie uvádzajú, že MEN2 mutácie sú lokalizované v exóne 8,10,11, 13, 14, 15,16. Na našom oddelení sa vyšetrujú všetky spomínané exóny. Moderné techniky molekulárnej biológie umožňujú včasnú diagnózu MEN2 syndrómu spojeného s mutáciou v RET géne u rodín s dedičnou predispozíciou na uvedené ochorenie. Na skríning (hľadanie) zárodočnej mutácie je potrebné získať vzorku DNA od vhodného člena rodiny, najčastejšie jedinca s diagnostikovaným nádorovým ochorením. V prípade ak sa podarí nájsť zárodočnú mutáciu u jedného člena rodiny, spravidla už postihnutého nádorovým ochorením, je možné vykonávať cielené hľadanie tej istej mutácie aj u ostatných príbuzných. Molekulárne- genetické vyšetrenie na prítomnosť mutácie v RET géne umožňuje jednoznačne stanoviť u príbuzných kto zdedil mutáciu a je vystavený riziku vzniku nádoru v pribehu života a kto nezdedil mutáciu a je bez rizika vzniku tohto typu nádoru.
Postup smerujúci k vyšetreniu génu RET:
- ako prvý krok je nutné absolvovať genetickú konzultáciu u klinického genetika (zoznam ambulancií TU)
- spĺňať indikačné kritériá
- genetické vyšetrenie začína od žijúceho pacienta
Dĺžka vyšetrenia: Vyšetrenie vzorky DNA od jedného pacienta trvá približne 1 mesiac. Čakacie doby od príjmu vzorky po ukončenie analýzy sú približne 1-2 mesiace.
V prípade cieleného vyšetrenia prítomnosti už známej patologickej mutácie v rámci rodiny trvá približne 1 mesiac, pričom vzorka je analyzovaná ihneď po príjme.
Materiál na vyšetrenie, transport: Do skúmavky typu Vacutainer s EDTA (ružový vrchnák, ako na krvný obraz) sa odoberie 1 ml periférnej krvi. Vzorka sa následne označí menom, rokom narodenia pacienta a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na adresu OLG ÚLVM, OÚSA. Odber nemusí byť realizovaný nalačno.
Pri vzorkách určených na DNA analýzu sa periférna krv môže bez zmeny kvality DNA transportovať 1 až 2 dni, príp. aj poštou, avšak vzorka musí byť dostatočne zabezpečená proti poškodeniu, resp. vyliatiu a znehodnoteniu. V prípade zmrazenia vzorky periférnej krvi sa vzorka následne skladuje a transportuje výlučne zmrazená pri -15°C v mraziacom boxe až do izolácie DNA.
Indikačné kritériá na vyšetrenie: Vyšetrenie začína od žijúceho postihnutého pacienta.
- Akýkoľvek výskyt medulárneho karcinómu štítnej žľazy v rodine.
- Akýkoľvek výskyt bilaterálnej alebo multifokálnej formy feochromocytómu v rodine.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 1 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dedičná forma malígneho melanómu (HMM, gén CDKN2A)
V posledných 20-tich rokoch sa každoročne zvyšuje počet prípadov nádorových ochorení kože. Hoci malígny melanóm je menej častým ako iné formy zhubných nádorov kože, predstavuje veľmi agresívnu formu tohto ochorenia.
Príčinu ochorenia nie je jednoduché určiť, vo väčšine prípadov je to kombinácia viacerých faktorov, a to hlavne enviromentálnych. Na druhej strane sa odhaduje, že približne v 10% prípadoch sa pozoroval familiárny výskyt, u ktorého sa predpokladá dedičný základ. Pod familiárnym typom ochorenia sa rozumie vyšší výskyt daného ochorenia v rodine (u prvo- a druho- stupňových príbuzných). Avšak pre dedičný typ malígneho melanómu nie je charakteristická len familiarita, ale aj nástup ochorenia v mladšom veku a prítomnosť mnohopočetného primárneho melanómu u jednej osoby alebo prítomnosť karcinómu pankreasu v rodine. Tieto vlastnosti dedičnej formy melanómu sú zároveň indikačnými kritériami vyšetrenia (viď nižšie).
Za jeden z najčastejšie mutovaných génov v rodinách s familiárnou formou melanómu (FM) sa považuje gén CDKN2A. Literatúra uvádza frekvenciu záchytu mutácií približne 15%-20% v rodinách s familiárnou formou.
Germinatívne (dedičné) mutácie v géne CDKN2A sú zodpovedné za zvýšené riziko vývoja malígneho melanómu a iných nádorov kože, zároveň tiež môžu byť zodpovedné za vznik iných typov nádorového ochorenia, a to hlavne karcinómu pankreasu, v menšej miere karcinómu prsníka .
Vyšetruje sa celá kódujúca sekvencia génu CDKN2A, kódujúca proteín p16INK4 a tiež kódujúca sekvencia p14ARF. To jest exóny 1A, 2, 3, 1B s priľahlými oblasťami a tiež promótorová oblasť pre p16INK4.
Postup smerujúci k vyšetreniu génu CDKN2A:
- ako prvý krok je nutné absolvovať genetickú konzultáciu u klinického genetika (zoznam ambulancií TU)
- spĺňať indikačné kritériá
- genetické vyšetrenie začína od žijúceho pacienta
Dĺžka vyšetrenia: Vyšetrenie vzorky DNA od jedného pacienta trvá približne 1-2 týždne. Čakacia doba od príjmu vzorky po ukončenie analýzy, teda odoslanie správy žiadajúcemu lekárovi, je približne 1 mesiac.
V prípade cieleného vyšetrenia prítomnosti už známej patologickej mutácie v rámci rodiny trvá vyšetrenie približne 2 týždne, pričom vzorka je analyzovaná ihneď po príjatí.
Materiál na vyšetrenie, transport: Do skúmavky typu Vacutainer s EDTA (ružový vrchnák, ako na krvný obraz) sa odoberie 1 ml periférnej krvi. Vzorka sa následne označí menom, rokom narodenia pacienta a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na adresu OLG ÚLVM, OÚSA. Odber nemusí byť realizovaný nalačno.
Pri vzorkách určených na DNA analýzu sa periférna krv môže bez zmeny kvality DNA transportovať 1 až 2 dni, príp. aj poštou, avšak vzorka musí byť dostatočne zabezpečená proti poškodeniu, resp. vyliatiu a znehodnoteniu. V prípade zmrazenia vzorky periférnej krvi sa vzorka následne skladuje a transportuje výlučne zmrazená pri -15°C v mraziacom boxe až do izolácie DNA.
Indikačné kritériá na vyšetrenie: Vyšetrenie začína od žijúceho postihnutého pacienta.
- Traja a viacerí príbuzní s malígnym melanómom v jednej línii bez ohľadu na vek.
- Dvaja príbuzní I. alebo II. st. s malígnym melanómom alebo malígnym melanómom a karcinómom pankreasu pričom aspoň v jednom prípade ochorenie diagnostikované do 50 rokov.
- Jeden postihnutý s viacpočetným malígnym melanómom (aspoň 3 ložiská) alebo duplexnou formou malígneho melanómu a karcinómu pankreasu.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 1 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Vyšetrenie exónov 1-5 génu PRSS1 a exónov 1-4 génu SPINK1 u pacientov s akútnou/chronickou pankreatitídou
Podstatou diagnostiky je dôkaz germinatívnych variantov/mutácií v génoch PRSS1 a SPINK1.
Gén PRSS1 kóduje kationický trypsinogén, ktorý štiepi peptidové väzby proteínov a uvoľnuje voľné aminokyseliny. Výskyt mutácií v tomto géne môže spôsobiť predčasnú aktiváciu trypsinogénu na trypsínu už v pankrease (nie až v duodene), príp. zlyhanie deaktivácie predčasne aktivovaného trypsínu. Výskyt takýchto mutácií v géne PRSS1 vedie k hereditárnej chronickej pankreatitíde.
SPINK1, ktorý kóduje tzv. serin protease inhibitor Kazal type I, inhibuje približne 20% celkovej aktivity trypsínu v pankrease. Zabezpečuje tak dôležitú ochranu pred predčasne aktivovaným trypsínom. Výskyt popísaných variantov v géne SPINK1 spôsobuje výmenu aminokyseliny v proteíne, čo hlavne v blízkosti reaktívneho centra môže spôsobiť zníženie inhibičnej kapacity proteínového produktu, a býva preto asociovaný s výskytom chronickej pankreatitídy.
Vyšetrenie génu SPINK1 je odporúčané u pacientov s diagnostikovanou chronickou pankreatitídou, prípadne akútnou pankreatitídou ako doplňujúce vyšetrenie v prípade negatívneho výsledku vyšetrenia génu PRSS1. Pacienti, u ktorých bola najdená mutácia/variant či už v géne PRSS1 alebo SPINK1, sú zaradení do špeciálnych preventívnych programov, nakoľko je hlavne u pacientov s mutáciu v géne PRSS1 zvýšené riziko karcinómu pankreasu o 50%.
Postup vyšetrenia:
- ako prvý krok je nutné absolvovať genetickú konzultáciu u klinického genetika (zoznam ambulancií TU)
- spĺňať indikačné kritériá
- genetické vyšetrenie začína od žijúceho pacienta
Indikačné kritériá na vyšetrenie:
- idiopatická chronická pankreatitída (Dg. K86.1),
- dve alebo viac epizód dokumentovanej akútnej pankreatitídy (K85, nutné vylúčiť známe príčiny),
- výskyt pankreatitídy u ďalšieho pokrvne príbuzného člena rodiny,
- akútna idiopatická forma pankreatitídy u dieťaťa- stačí aj jeden dokumentovaný atak.
Dĺžka vyšetrenia: Vyšetrenie vzorky DNA od jedného pacienta trvá 1-2 týždne. Čakacie doby, od príjmu vzorky po zaslanie výsledkov žiadajúcemu lekárovi, sú približne 1 mesiac.
Materiál na vyšetrenie, transport: Do skúmavky typu Vacutainer s EDTA (ružový vrchnák, ako na krvný obraz) sa odoberie 1 ml periférnej krvi. Vzorka sa následne označí menom, rokom narodenia pacienta a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na adresu OLG ÚLVM, OÚSA. Odber nemusí byť realizovaný nalačno.
Pri vzorkách určených na DNA analýzu sa periférna krv môže bez zmeny kvality DNA transportovať 1 až 2 dni, príp. aj poštou, avšak vzorka musí byť dostatočne zabezpečená proti poškodeniu, resp. vyliatiu a znehodnoteniu. V prípade zmrazenia vzorky periférnej krvi sa vzorka následne skladuje a transportuje výlučne zmrazená pri -15°C v mraziacom boxe až do izolácie DNA.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 1 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Hereditárny nepolypózny karcinóm kolorekta (HNPCC, Lynchov syndróm; gény MLH1, MSH2, MSH6, vyšetrenie veľkých genómových prestavieb)
Karcinómy hrubého čreva (CRCa) patria medzi najčastejšie nádorové ochorenia v industrializovaných krajinách. Podľa štatistiky WHO z roku 1995 sa Slovensko nachádza na 3. mieste v rebríčku výskytu rakoviny kolorekta v Európe.
Okrem sporadickej formy časť spektra CRCa reprezentujú dedičné formy (12-15%), z ktorých najznámejšií a najlepšie popísaný je hereditárny nepolypózny karcinóm kolorekta (HNPCC). Hereditárny nepolypózny karcinóm kolorekta patrí medzi autozomálne dominantné dedičné ochorenie s predispozíciou na vznik kolorektálneho karcinómu (CRCa) alebo ďalších extrakolonických nádorov (adenokarcinómy endometria, žalúdka, karcinómy vaječníkov, močového traktu, tenkého čreva, nádory mozgu a kože). HNPCC syndróm je spôsobený zárodočnými mutáciami v génoch reparačného systému (hMLH1, hMSH2, hMSH6, hPMS1, hPMS2, hMLH3, hMSH3), ktorý sa zúčastňuje na oprave chybne spárovaných báz, tzv. „mismečov“. Väčšinu doteraz identifikovaných zárodočných mutácií (viac ako 80%) predstavujú mutácie v génoch hMLH1 a hMSH2.
Moderné techniky molekulárnej biológie umožňujú včasnú diagnózu HNPCC syndrómu spojeného s mutáciami v génoch MLH1, MSH2, MSH6 géne u rodín s dedičnou predispozíciou na uvedené ochorenie. Na skríning (hľadanie) zárodočnej mutácie je potrebné získať vzorku DNA od vhodného člena rodiny, najčastejšie jedinca s diagnostikovaným nádorovým ochorením. V prípade ak sa podarí nájsť zárodočnú mutáciu u jedného člena rodiny, spravidla už postihnutého nádorovým ochorením, je možné vykonávať cielené hľadanie tej istej mutácie aj u ostatných príbuzných. Molekulárne- genetické vyšetrenie na prítomnosť mutácie v génoch MLH1, MSH2, MSH6 umožňuje jednoznačne stanoviť u príbuzných kto zdedil mutáciu a je vystavený riziku vzniku nádoru v priebehu života a kto nezdedil mutáciu a je bez rizika vzniku tohto typu nádoru.
Pre realizáciu tohto špeciálneho genetického vyšetrenia je nutné splniť niekoľko podmienok:
- absolvovať genetickú konzultáciu u klinického genetika (zoznam ambulancií TU)
- spĺňať indikačné kritériá
- genetické vyšetrenie začína od žijúceho pacienta
Dĺžka vyšetrenia:
Vyšetrenie vzorky DNA jedného génu od jedného pacienta trvá približne 1 mesiac. Čakacie doby od príjmu vzorky po ukončenie analýzy sú približne 1-2 mesiace.
V prípade cieleného vyšetrenia prítomnosti už známej patologickej mutácie v rámci rodiny trvá približne dva týždne, pričom vzorka je analyzovaná ihneď po príjme.
Materiál na vyšetrenie, transport: Do skúmavky typu Vacutainer s EDTA (ružový vrchnák, ako na krvný obraz) sa odoberie 1 ml periférnej krvi. Vzorka sa následne označí menom, rokom narodenia pacienta a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na adresu OLG ÚLVM, OÚSA. Odber nemusí byť realizovaný nalačno.
Pri vzorkách určených na DNA analýzu sa periférna krv môže bez zmeny kvality DNA transportovať 1 až 2 dni, príp. aj poštou, avšak vzorka musí byť dostatočne zabezpečená proti poškodeniu, resp. vyliatiu a znehodnoteniu. V prípade zmrazenia vzorky periférnej krvi sa vzorka následne skladuje a transportuje výlučne zmrazená pri -15°C v mraziacom boxe až do izolácie DNA.
Indikačné kritériá na vyšetrenie: Vyšetrenie začína od žijúceho postihnutého pacienta.
| Názov |
Kritériá |
| Amsterdamské kritériá I (AC I) - 1991 |
Najmenej 3 príbuzní s kolorektálnym karcinómom, pričom všetky tieto kritériá musia byť splnené:
- jeden z nich je prvostupňový príbuzný ostatných dvoch
- sú postihnuté najmenej dve po sebe idúce generácie
- minimálne jedna postihnutá osoba má menej ako 50 rokov
- musí byť vylúčená FAP
|
| Amsterdamské kritériá II (AC II) - 1999 |
Najmenej 3 príbuzní s HNPCC-asociovaným nádorom (črevo, endometrium, tenké črevo, močovod, obličky).
Musia byť splnené všetky Amsterdamské kritériá I. |
| Bethesda kritériá(BG) - 1997 |
- Pacienti s nádormi z rodiny, ktorá spĺňa Amsterdamské kritériá
- Pacienti s dvoma HNPCC-asociovanými nádormi, zahrňujúce synchrónne aj metachrónne kolorektálne tumory alebo asociované extrakolonické nádory (v endometriu, vaječníkoch, žalúdku, hepatobiliárnom systéme, tenkom čreve alebo karcinóm obličkovej panvičky z prechodného epitelu resp. močovodu)
- Pacienti s kolorektálnym nádorom, ktorí majú prvostupňového príbuzného s kolorektálnym nádorom a/alebo s HNPCC-asociovaným extrakolonickým nádorom a/alebo s kolorektálnym adenómom; jeden z nádorov je diagnostikovaný vo veku < 45 rokov a adenóm diagnostikovaný vo veku < 40 rokov
- Pacienti s kolorektálnym alebo endometriálnym nádorom diagnostikovaným vo veku < 45 rokov
- Pacienti s pravostranným kolorektálnym karcinómom s nediferencovaným histopatologickým vzorom (solídny/kribriformný), ktorý je diagnostikovaný vo veku < 45 rokov
- Pacienti s kolorektálnym karcinómom s prstencovitými bunkami, ktorý je diagnostikovaný vo veku < 45 rokov (> 50% prstencovitých buniek)
- Pacienti s kolorektálnymi adenómami, ktoré sú diagnostikované vo veku < 40 rokov
|
| Revidované Bethesda kritériá (RBG)- 2004 |
- Pacient má menej ako 50 rokov
- Pacient má viaceré synchrónne alebo metachrónne HNPCC-asociované tumory
- Pacient má menej ako 60 rokov a má kolorektálny nádor s mikroskopickými charakteristikami nádorov s mikrosatelitovou instabilitou (MSI)
- Pacient má jedného alebo viacerých prvostupňových príbuzných vo veku 50 alebo menej rokov s HNPCC-asociovanými tumormi
- Pacient má 2 alebo viac prvostupňových alebo druhostupňových príbuzných, ktorí mali HNPCC-asociovaný tumor v akomkoľvek veku
|
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 1 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dôkaz vysokorizikových HPV vírusov (hybridizačnou metódou HC2)
Karcinóm krčku maternice je jedným z najčastejších nádorových ochorení v populácii žien. V prevažnej väčšine toto ochorenie spôsobujú niektoré typy vírusu ľudských papilomavírusov (HPV). HPV je bežný vírus, ktorý postihuje ženy aj mužov. S karcinómom krčka maternice je asociovaných len niekoľko typov HPV vírusov, nazývaných ako vysoko rizikové (high risk) HR-HPV.
Metóda Hybrid Capture 2 (HC2) je testom založeným na hybridizácii nukleovej kyseliny pre kvalitatívnu detekciu 13 typov HPV DNA s vysokým rizikom. Daný kit je určený pre detekciu typov HR-HPV: 16/18/31/33/35/39/45/51/52/56/58/59/68, pri ktorých bolo dokázané, že sú primárnym príčinným faktorom pre vznik rakoviny krčku maternice
Pozitívny výsledok dokazuje kvalitatívnu prítomnosť niektorého alebo viacerých z uvedených HR-HPV, avšak táto metóda neurčí presný genotyp prítomného HR-HPV vo vzorke z exocervixu.
Cervikálne vzorky, ktoré majú byť testované metódou DNA testu HC2 HR-HPV musia spĺňať nasledujúce požiadavky:
- vzorky odoberané s použití súpravy DNAPapTM Cervical SamplerTM alebo HC Cervical SamplerTM
- vzorky bunkovej suspenzie z krčka maternice odoberané s použití kefky, ktorá je vložená v roztoku Cytyc PreservCyt ®
- vzorky doberané do konzervačnej tekutiny TriPath Imaging® SurePath®
- biopsia umiestnená do média pre prenos vzoriek
Použitie testu je určené k nasledujúcim účelom:
- Pre detekciu HR-HPV: HPV 16/18/31/33/35/39/45/51/52/56/58/59/68 pri ktorých bolo dokázané, že sú primárnym príčinným faktorom pre vznik rakoviny krčku maternice.
- Ako počiatočný screening test všeobecnej populácie, pre použitie v spojení s PAP náterom alebo bez neho k vytypovaniu žien, ktoré vykazujú zvýšené riziko pre vznik cervikálnej rakoviny alebo už majú cervikálne ochorenie v rozvinutom štádiu. HPV diagnóza poukazuje vo zvýšenej miere na cervikálne ochorenie so zvyšujúcim sa vekom.
- Ako ďalší následný test pre pacientky s abnormálnym výsledkom PAP náteru (ASCUS) alebo s cervikánym ochorením.
Dĺžka vyšetrenia: Vyšetrenie HR-HPV metódou HC2 trvá približne 1 týždeň.
Materiál na vyšetrenie, transport:
Bunkový ster z exocervixu sa odoberá do komerčných skúmaviek DNA PAP Cervical Sampler TM., komerčne dodávanou kefkou, ktorú treba zalomiť a nechať v skúmavke. Bunkový eluát je možné uchovávať v chladničke do 1 týždňa, ak sa vzorky uchovávajú dlhšie je potrebné ich zmraziť na -15°C. O zaslanie skúmavok na vyšetrenie HR-HPV HC2 metódou a o zabezpečenie transporu je možné požiadať na OLG OÚSA na t. č. 02/59249576.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 2 (na stiahnutie)
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 2-SAMOPLATCA (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dôkaz a typizácia vysokorizikových HPV vírusov (IVD komerčnými kitmi)
Genotypizácia HPV je založená na PCR amplifikácii a je zameraná na stanovenie presného genotypu onkogénnych typov HPV- HR-HPV a vírusov asociovaných s vývojom kondylómov a papilómov bez onkogénneho rizika - LR-HPV.
Metódou genotypizácie HPV dokazujeme:
- kompletnú sadu HR-HPV
- LR-HPV : 6 a 11
Na genotypizáciu HPV používame komerčné IVD kity s certifikátom CE a akreditovanú PCR metódu splňujúcu normu ISO 17025.
Vyšetrenie indikuje:
Gynekológ resp. gynekológ-onkológ, dermatológ, otolaryngológ, urológ, chirurg-stomatológ, oftalmológ, gastro-enterológ a iní.
Použitie testu je určené na nasledujúce účely:
- prítomnosť HPV infekcie v materiáli z rôznych anatomických lokalizácií (uretra, koža, respiratórne papilómy, intraepiteliálne neoplázie rôznych stupňov v anogenitálnej oblasti - vagína, vulva, penis, prekarcinózne stavy hlavy a krku, análne kracinómy a pod.)
- perzistenciu infekcie rovnakým typ HR-HPV
- prítomnosť viacerých klonov HR-HPV u jednej pacientky
- prítomnosť minimálnej reziduálnej infekcie po ablatívnom zákroku na krčku maternice, ktorá môže naznačovať zvýšené riziko minimálnej reziduálnej choroby (MRCH)
- prítomnosť HR-HPV 16 a 18 a LR-HPV 6 a 11 pred plánovanou vakcináciou
- vyšetrenie je možné uskutočniť aj pre samoplatcov
Odber materiálu a transport:
Odber materiálu pre genotypizáciu HPV sa robí do sterilných skúmavok s vrchnákom so závitom. V skúmavke sú sterilne rozalikvotované 2 ml roztoku PBS. Skúmavky sa do použitia uchovávajú v chladničke. Po odbere materiálu je možné skúmavky krátkodobo (max. 1 deň) uchovávať v chladničke. Ak nie je denný transport vzorky, potom je potrebné vzorky zmraziť do doby transportu aspoň na cca -16°C. O zaslanie skúmavok na genotypizáciu HPV a o zabezpečenie transportu je možné požiadať OLG OÚSA na t. č. 02/59249576.
Spolu s materiálom je potrebné zaslať aj vyplnenú žiadanku s vyznačením požadovaného vyšetrenia.
Pre genotypizáciu HPV je potrebné poznať aktuálny cytologický / histologický nález pre lepšiu interpretáciu výsledkov genotypizácie.
Dĺžka vyšetrenia:
Genotypizácia HPV trvá približne 1-2 týždne od prevzatia vzorky.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 2 (na stiahnutie)
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 2-SAMOPLATCA (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dôkaz malígnych prekurzorov pomocou expresie onkogénov E6/E7 HR-HPV a molekulového podpisu
Vírusová DNA sa za určitých okolností môže relatívne jednoducho stať súčasťou bunkového genómu. Proces spájania sa vírusového a ľudského genómu do jedného celku sa označuje ako integrácia vírusovej DNA do DNA bunky. Integrovaný onkogénny papilomavírus (HR-HPV) dereguluje bunkový cyklus, čo je prvý krok k ireverzibilnej transformácii bunky.
Vírusy HR-HPV po infekcii bunky nevyvolávajú vždy vznik karcinómu. Onkogénne typy HPV môžu v bunke perzistovať v produktívnej epizomálnej forme (zachovávajú si cirkulárny genóm) a vďaka imunitnému systému môžu byť v priebehu 12-24 mesiacov úplne eradikované. Karcinóm sa začne vyvíjať iba v tom prípade, keď infekcia v bunke a tkanive perzistuje dlhšiu dobu (viac ako 12-24 mesiacov), pričom sa vyvíjajú rôzne stupne malígnych prekurzorov (cervikálne intraepiteliálne neoplázie, CIN I-III), v ktorých môže nastať integrácia genómu HPV do hostiteľského genómu (neproduktívna infekcia).
Podľa zahraničnej literatúry až v 93% karcinómov in situ a v invazívnych karcinómoch krčka maternice pravidelne dokazovali expresiu vírusových onkogénov E6 a E7. Pritom pacientky s karcinóm krčka maternice s vysokou expresiou vírusových onkogénov E6 a E7 mali horšiu prognózu a kratšie prežívanie a to nezávisle od ďalších prognostických faktorov. Navyše sa zistilo, že iba kontinuálna expresia vírusových onkogénov E6 a E7 udržuje malígny genotyp a fenotyp bunky. Preto jednoznačný dôkaz integrovaného HPV genómu, ktorý je sprevádzaný expresiou vírusových onkogénov E6 a E7, je možné považovať za genetický marker včasnej neoplastickej transformácie bunky a progresie k CIN vyšších stupňov.
Expresia onkogénov E6 a E7 sa v súčasnosti dokazuje pomocou molekulových metód založených na charakterizácii RNA/mRNA pre 14 genotypov HR-HPV. Na vyšetrenie používame komerčné IVD kity s certifikátom CE a akreditovanú PCR metódu splňujúcu normu ISO 17025.
Dôkaz exptresie onkogénov HPV uskutočňujeme nie len v bunkových steroch z exocervixu, ale aj v materiáli z rôznych anatomických lokalizácií (vid. 3.5.)
Vyšetrenie indikuje:
Gynekológ, gynekológ-onkológ.
Použitie testu je určené na nasledujúce účely:
- odhalenie skrytých cervikálnych intraepiteliálnych neoplázií vyšších stupňov (CIN II-III až CIS) u pacientok s perzistujúcim zhoršeným OC nálezom L SIL (CIN I) po dobu viac ako 24 mesiacov.
- odhalenie prítomnosti minimálnej reziduálnej choroby (MRCH) po ablatívnom zákroku
- odhalenie prítomnosti viacerých klonov s intergrovanou kópiu HR-HPV.
Odber materiálu a transport:
Stery z exocervixu sa odoberajú paralelne s onko-cytologickým odberom. Bunky sa eluujú do roztoku RNAlater na ochranu RNA v špeciálnych expresných skúmavkách. Materiál sa do doby transportu uchováva v chladničke alebo mrazničke. Expresné skúmavky dodá na požiadanie naše OLG (tel.: 02 / 592 49 576, 575).
Spolu s materiálom je potrebné zaslať aj vyplnenú žiadanku s vyznačením požadovaného vyšetrenia.
Pre dôkaz skrytých CIN vyšších stupňov je potrebné poznať aktuálny cytologický / histologický nález pre lepšiu interpretáciu výsledkov.
Dĺžka vyšetrenia:
Vyšetrenie trvá približne 1-2 týždne od prevzatia vzorky.
Molekulový podpis cervikálnych intraepiteliálnych neoplázií krčka maternice (CIN).
Cervikálne intraepiteliálne neoplázie rôznych stupňov (CIN I - III) predchádzajú vývoju invazívneho karcinómu krčka maternice. Etiopatogenetickým faktorom vzniku karcinómu krčka maternice sú vírusy s vysokým onkogénnym rizikom (HR-HPV), ktoré po integrácii do genómu bunky spúšťajú deregulovaný proces bunkového delenia.
Deregulovaný proces bunkového delenia je charakteristický zvýšenou expresiou viacerých génov, ktoré posúvajú bunkový cyklus z fázy G1 do S bez zastavenia v kontrolnom bode (check-pointe). Medzi tieto gény patria najmä: CDKN1, CDKN2, Ki67 a iné.
Podľa literárnych údajov, stúpajúca hladina CDKN1 aj CDKN2 dokazuje prítomnosť deregulovaných buniek v dôsledku integrácie HR-HPV, pričom ich hladina plynulo stúpa so stúpajúcim stupňom CIN. CDKN sú preto vhodnými markermi na dôkaz progresie z CIN nižších stupňov do CIN vyšších stupňov.
Expresia Ki67 lineárne stúpa so zvyšujúcim sa stupňom CIN, ale miera expresie tohto markera nezávisí iba od integrácie HR-HPV. Z tohto dôvodu je možné stúpajúcu expresiu Ki67 považovať za dobrý marker pri vývoji endocervikálneho adenokarcinómu, pri ktorom integrácia HR-HPV nehrá rozhodujúcu úlohu.
Expresia Top2a býva asociovaná s expresiou CDKN2, a preto sa používa ako ďalší marker sledovania deregulácie bunkového cyklu a zároveň progresie CIN. Zvýšená hladina Top2a je zároveň favorizujúcim znakom pri liečbe antracyklínovými derivátmi a jedmi topoizomeráz.
Molekulový podpis CIN rôznych stupňov sa líši mierou expresie uvedených génov, čo je možné použiť pri presnejšej charakterizácii biologických vlastností buniek, a tým aj jednotlivých stupňov CIN. Pomocou molekulového podpisu je možné včas identifikovať progresiu CIN a personalizovať terapiu. Molekulový podpis vhodne dopĺňa onkocytologickú a histopatologickú charakterizáciu.
Vyšetrenie indikuje:
gynekológ, gynekológ-onkológ.
Použitie testu je určené na nasledujúce účely:
- detekciu skrytých CIN vyšších stupňov
- odhalenie CIN I s vysokým rizikom progresie do CIN II-III
- odhalenie endocervikálneho adenokarcinómu a jeho prekurzorov
Odber materiálu a transport:
Stery z exo- alebo endocervixu sa odoberajú paralelne s onko-cytologickým odberom. Bunky sa eluujú do roztoku RNAlater na ochranu RNA v špeciálnych expresných skúmavkách. Materiál sa do doby transportu uchováva v chladničke alebo mrazničke. Expresné skúmavky dodá na požiadanie naše OLG (tel.: 02 / 592 49 576, 575).
Spolu s materiálom je potrebné zaslať aj vyplnenú žiadanku s vyznačením požadovaného vyšetrenia.
Pre dôkaz skrytých CIN vyšších stupňov je potrebné poznať aktuálny cytologický/histologický nález pre lepšiu interpretáciu výsledkov.
Dĺžka vyšetrenia:
Vyšetrenie trvá 1-2 týždne od dodania vzorky na naše OLG. Vyšetrenie sa vykonáva súčasne s vyšetrením expresie HPV onkogénov E6/E7
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 2 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dôkaz cirkulujúcich nádorových buniek (CTC) u pacientok s karcinómom krčka maternice v lymfovaskulárnom systéme
Procesu metastazovania karcinómu krčka maternice predchádza proces uvoľňovania nádorových buniek z primárneho tumoru a cirkulácia nádorových buniek (CTC) v periférnej krvi (PK) pacientky. V prípade generalizácie nádorovej choroby je možné v cca 7,5 ml PK pacientov dokázať desiatky až tisícky CTC. U zdravého človeka je dôkaz cirkulujúcich epiteloidných buniek sporadický a nikdy nepresiahol počet 2 epiteloidné bunky v cca 7,5 ml PK.
Prítomnosť integrovaného genómu HR-HPV je jedinečným genetickým markerom na rozlíšenie cirkulujúcich nádorových buniek z karcinómu krčka maternice od zdravých jadrových buniek v PK, ktoré neobsahujú genóm HR-HPV. Dôkaz CTC sa uskutočňuje pomocou genotypizácie HR-HPV (viď. kap. 3.5.) v imunomagneticky zahustených epiteloidných bunkách s následným potvrdením viability nádorových buniek pomocou expresie onkogénov E6/E7 HR-HPV (viď. kap. 3.6).
Vyšetrenie indikuje:
gynekológ-onkológ, internista-onkológ.
Použitie testu je určené na nasledujúce účely:
- detekcia CTC na zachytenie generalizácie nádorovej choroby
- hodnotenie efektívnosti terapie
- odhalenie možnej rekurencii nádorovej choroby
- odhalenie možnej rezistencie na terapiu
Odber materiálu a transport:
Odber cca 8 ml PK sa robí do jednorazových skúmavok s EDTA (pre krvný obraz). Odobratá PK sa v deň odberu musí transportovať na naše OLG ULVM. Materiál sa nesmie zmraziť.
Spolu s materiálom je potrebné zaslať aj vyplnenú žiadanku s vyznačením požadovaného vyšetrenia.
Vyšetrenie je potrebné vopred telefonicky dohodnúť (tel.: 02/59249- 576, 575).
Pre interpretáciu výsledkov je potrebné poznať aktuálny klinický nález, prípadne aj hodnoty sérových markerov SCCA a CA125.
Dĺžka vyšetrenia:
Vyšetrenie trvá približne 1 týždeň od prevzatia vzorky.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 2 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Dôkaz patologickej expresie génov zodpovedných za vývoj rezistencie na chemoterapiu (MDR)
Účinnosť liečby onkologického pacienta (solidné tumory, lymfómy a leukémie) fundamentálne závisí od výberu efektívne fungujúceho chemoterapeutika. Mnoho pacientov sa dostáva do recidívy nádorovej choroby v dôsledku rezistencie na primárnu chemoterapiu (vnútorná rezistencia). Rezistencia sa vyvíja aj počas primárnej chemoterapie (získaná rezistencia). Príčiny rezistencie sú v súčasnosti dobre preštudované.
Medzi najčastejšie príčiny rezistencie patrí patologická aktivita 48-51 génov patriacich do tzv. ABC kazety transportérov. Transportéry spôsobujú eflux cytostatika z bunky do extracelulárneho prostredia, tým spôsobujú neúčinnosť cytostatickej liečby a zároveň zvýšenú toxicitu pacienta v dôsledku voľného cirkulujúceho cytostatika.
Z literárnych údajov citovaných je známe, že najčastejšie patologicky nadexprimované gény ABC kazety sú gény ABCB1 (Pgp, MDR1), ABCC1 (MRP1) a ABCG2 (BCRP). Z tohto dôvodu sa analýza patologickej expresie génov ABC kazety uskutočňuje minimálne u 10 génov ABC kazety popri house-keeperovom géne ako vnútornej kontroly.
Skríning patologickej expresie génov ABC kazety uskutočňujeme metódou micro-array, ktorá umožňuje simultánnu analýzu desiatok až tisícok génov súčasne. Po analýze micro-array sú vybrané do následnej kvantitatívnej analýzy pomocou Real-Time PCR (RT-PCR) iba tie gény ABC kazety, ktoré vykázali patologickú expresiu.
V rámci vyšetrenia sa uskutočňuje aj analýza expresie génov pre topoizomerázy. Topoizomerázy sú enzýmy, ktoré sa zúčastňujú rozpletania dvojvláknovej DNA na jednovláknové úseky počas replikácie. Komplexy DNA-topoizomeráza sú cieľom pre antracyklín a jeho deriváty ako aj jedy topoizomeráz. Počas liečby onkologického pacienta s týmito typmi látok sa predpokladá lepšia odpoveď na terapiu u pacientov s vyššou nadexpresiou génu/-ov pre topoizomerázu.
Analýzu vybraných génov ABC kazety a topoizomeráz dokazujeme pomocou tzv. zlatého štandardu v klinickej diagnostike génovej expresie - metódou RT-PCR s fluorescenčne značenými TaqMan sondami a pomocou softvéru pre relatívnu kvantifikáciu.
Podľa publikovaných literárnych údajov sa za patologickú považuje expresia aspoň 1,5x vyššia/nižšia v porovnaní s expresiou rovnakých génov zo zdravého tkaniva (referenčná vzorka).
Vyšetrenie indikuje:
internista-onkológ.
Použitie testu je určené na nasledujúce účely:
- dôkaz rizika vývoja rezistencie na určitý typ chemoterapie
- dôkaz rizika rekurencie napriek chemoterapii
- sledovanie efektívnosti chemoterapie
- umožňuje výber iného typu chemoterapie v prípade možnej voľby medzi rôznymi typmi terapeutík
- odhad miery účinnosti antracyklínov a jedov topoizomeráz
Odber materiálu a transport:
Materiál na kvantitatívnu analýzu poskytuje odd. patológie na OUSA z tzv. rýchleho rezu 1x týždenne, pričom natívne tkanivo je vložené do tekutiny RNAlater na ochranu RNA a následne zmrazené do doby analýzy.
Pre interpretáciu výsledkov je potrebné poznať aktuálny klinický nález a hodnoty sérových markerov CEA, CA15-3 a TPS u pacientok s karcinómom prsníka.
Dĺžka vyšetrenia:
Vyšetrenie trvá približne 1-2 týždne od prevzatia vzorky
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 4 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Analýza kodónov 12 a 13 génu KRAS pri metastatických karcinómoch kolorekta
Dôkaz prítomnosti somatických mutácií v géne KRAS (v kodónoch 12, 13 a 61) slúži ako predikčný marker rezistencie k biologickej terapii, t.j. k inhibítorom tyrozín kináz u pacientov s karcinómom pľúc a k inhibítorom receptoru epidermálneho rastového faktoru u pacientov s metastazujúcim karcinómom hrubého čreva (CRC). Pacienti s metastazujúcim karcinómom kolorekta a mutovaným KRAS génom nereagujú na liečbu pomocou EGFR inhibítorov (Panitumumab - Vectibix, Cetuximab - Erbitux), naopak pacienti s nemutovaným KRAS génom, t.j. wild-type sú vhodní na takúto liečbu.
Celkovo sa predpokladá, že približne 40% pacientov s metastatickým CRC nesie somatické mutácie v géne KRAS, a teda je rezistentných na klasickú liečbu. V slovenskej populácii sa nachádza približne 3400 prípadov CRC ročne, z toho metastatických približne 50% prípadov ročne.
Indikácia vyšetrenia:
Molekulárno-genetické vyšetrenie génu KRAS indikuje podľa uváženia lekár špecialista - klinický onkológ, príp. patológ pričom analýza prebieha pooperačne z parafínových bločkov primárneho tumoru. Vyšetrenie je podmienkou pre liečbu pomocou Cetuximabu a Panitumumabu.
Dĺžka vyšetrenia:
Vzorky na vyšetrenie sa kolektujú vždy 1 týždeň, t.j. od pondelka do piatka, pričom samotná analýza trvá 3-4 pracovné dni. Momentálne čakacie doby od príjmu vzorky po ukončenie analýzy sú približne 5-9 pracovných dní.
Materiál na vyšetrenie, transport:
Do prázdnej 2 ml eppendorfky narezať približne 30 mg fixovaného tkaniva (parafínového bločku), napr. optimálne 10 ks 10 μm rezov do jednej eppendorfky. Eppendorfka so vzorkou sa označí rodným číslom pacienta, príp. histologickým číslom bločku a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na OLG ÚLVM, OÚSA.
Prípadne možno zaslať ako materiál na vyšetrenie i celý parafinový blok s daným fixovaným tkanivom, pričom narezanie týchto blokov vyriešime interne a vyšetrený blok následne zašleme spolu s výsledkom analýzy späť žiadajúcemu lekárovi.
Pri vyšetrení KRAS odporúčame zasielať vzorku fixovaného tkaniva z primárneho nádoru kolorekta s maximálnou infiltráciou tumoru. Rovnako prosíme o zaslanie sprievodnej informácie o histologickom náleze príslušnej vzorky. V prípade zaslania iného typu tkaniva (napr. tukové tkanivo, uzlina, metastáza) nemusia výsledky analýzy kodónov 12, 13 génu KRAS súhlasiť so stavom uvedených mutácií v primárnom tumore.
Rezy fixovaného tkaniva môžu byť uskladnené pri izbovej teplote, t.j. nepodliehajú špeciálnym podmienkam transportu a uskladnenia. Avšak v prípade dlhodobého vystavenia materiálu teplote nad 50°C môže dôjsť k znehodnoteniu tkaniva, resp. DNA.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 3 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Analýza kodónu 600 génu BRAF pri papilárnych nádoroch štítnej žľazy
Vzostup výskytu nádorov štítnej žľazy v posledných troch desaťročiach predstavuje závažný medicínsky problém. Napriek zlepšeniu kvality zobrazovacích metód a biopsií, zostávajú možnosti, ktoré by umožnili lepšie charakterizovať prežívanie, respektíve mortalitu pacientov značne limitované. Jedným z riešení, ktoré umožňuje selektovať „rizikovejšiu skupinu pacientov" je analýza prognostických molekulárno- genetických markerov. V niektorých prípadoch možno na základe mutačného statusu určitého génu v príslušnom type nádoru možno určiť prognózu vývoja nádorového ochorenia.
Mutačný status v géne BRAF pri papilárnych karcinómoch štítnej žľazy môže slúžiť ako prognostický marker. Zistilo sa, že nosiči mutácie p.V600E v géne BRAF majú agresívnejšie tumory, pre ktoré je typický vznik metastáz, perzistencia choroby, návrat choroby a celkovo zhoršené prežívanie pacientov. Analýza mutácií v géne BRAF, tak predstavuje dôležitú informáciu o predpokladanom priebehu choroby nielen pre samotného pacienta ale aj pre lekára a môže byť užitočná pri voľbe samotnej iniciálnej terapie a pri následnom monitoringu pacienta.
Indikácia vyšetrenia:
Molekulárno-genetické vyšetrenie génu BRAF indikuje podľa uváženia lekár špecialista - endokrinológ, príp. patológ pričom analýza prebieha pooperačne z parafínových bločkov primárneho tumoru.
Dĺžka vyšetrenia:
Vzorky na vyšetrenie sa kolektujú vždy cca jeden mesiac, pričom samotná analýza trvá 4-5 pracovných dní. Analýza mutácií v géne BRAF sa v súčasnosti pri danom počte vzoriek vykonáva raz za mesiac. Vzhľadom na to, že samotná analýza trva 4-5 pracovné dni, predpokladáme, že v budúcnosti pri náraste počtu vzoriek bude prebiehať kolekcia vzoriek a následná analýza v kratších intervaloch.
Materiál na vyšetrenie, transport:
Do prázdnej 2 ml eppendorfky narezať približne 30 mg fixovaného tkaniva (parafínového bločku), napr. optimálne 10 ks 10 μm rezov do jednej eppendorfky. Eppendorfka so vzorkou sa označí rodným číslom pacienta, príp. histologickým číslom bločku a spolu s riadne vyplnenou žiadankou sa zašle na OLG ÚLVM, OÚSA.
Prípadne možno zaslať ako materiál na vyšetrenie i celý parafinový blok s daným fixovaným tkanivom, pričom narezanie týchto blokov vyriešime interne a vyšetrený blok následne zašleme spolu s výsledkom analýzy späť žiadajúcemu lekárovi.
Odporúčame zasielať vzorku fixovaného tkaniva z primárneho nádoru s maximálnou infiltráciou tumoru. Rovnako prosíme o zaslanie sprievodnej informácie o histologickom náleze príslušnej vzorky. Rezy fixovaného tkaniva môžu byť uskladnené pri izbovej teplote, t.j. nepodliehajú špeciálnym podmienkam transportu a uskladnenia. Avšak v prípade dlhodobého vystavenia materiálu teplote nad 50°C môže dôjsť k znehodnoteniu tkaniva, resp. DNA.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 3 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení
Analýza mutácií v exónoch 18-21 génu EGFR pri nemalobunkovom karcinóme pľúc
Mutácie v onkogéne EGFR sa frekventovane nachádzajú v rôznych typoch nádorov. Prítomnosť takýchto mutácií u pacientov s nemalobunkovým karcinómom pľúc súvisí s lepšou odpoveďou na inhibítory EGFR. V dôsledku vyššej špecificity a afinity malých molekúl k mutovanému EGFR receptoru dochádza k inhibícii aberantných signálnych dráh, čo prináša benefit pacientov s mutovaným EGFR receptorom.
V slovenskej populácii sa celkovo nachádza približne 2 600 prípadov karcinómov pľúc ročne (údaje Národného onkologického registra za rok 2004), z toho približne 2 000 prípadov pripadá na nemalobunkový karcinóm pľúc.
Približne 10% pacientov s nemalobunkovým karcinómom pľúc nesie somatické mutácie v géne EGFR, čiže môžu profitovať z liečby pomocou malých molekúl (napr. Gefitinib).
Indikácia vyšetrenia:
Molekulárno-genetické vyšetrenie génu BRAF indikuje podľa uváženia lekár špecialista - onkológ, pneumológ (bronchoskopista), príp. patológ pričom analýza prebieha z cytologických sterov alebo bioptického materiálu
Materiál a transport:
Bunkové bronchiálne stery- nátery na sklíčko - odber materiálu sa pomocou bronchoskopickej kefky z nádoru uskutočňuje počas bronchoskopie. Po odbere materiálu sa ster rozotrie na cytologické podložné sklíčko. Pre analýzu je vhodné poslať 2-3 nezafarbené zafixované sklíčka. Po nátere sa sklíčka nechajú zaschnúť a následne sa zafixujú 70% etanolom, 5 minút.
Biopsia- ak to situácia dovoľuje možno odobrať pomocou bronchoskopiálnych nožničiek natívne tkanivo z miesta nálezu do PBS, alebo fyziologického roztoku, prípadne získanu biopsiu poslať na patológiu, kde dochádza k fixácii materiálu.
K odobratému materiálu prosíme taktiež posielať kópiu histologckej/ cytologickej správy.
Sklíčka sa transportujú na OLG, ÚLVM, OÚSA bez špeciálnych nárokov na podmienky transportu. Natívne tkanivo v 2 ml eppendorfkách sa skladuje a transportuje pri 4°C.
Fixované tkanivo alebo rezy fixovaného tkaniva môžu byť uskladnené pri izbovej teplote, t.j. nepodliehajú špeciálnym podmienkam transportu a uskladnenia. Avšak v prípade dlhodobého vystavenia materiálu teplote nad 50°C môže dôjsť k znehodnoteniu tkaniva, resp. DNA.
Dĺžka vyšetrenia:
Vzorky na vyšetrenie sa kolektujú vždy 1 týždeň, t.j. od pondelka do piatka, pričom samotná analýza trvá 3-4 pracovné dni. Momentálne čakacie doby od príjmu vzorky po ukončenie analýzy sú približne 5-9 pracovných dní.
ŽIADANKA NA VYŠETRENIE č. 3 (na stiahnutie)
Návrat na zoznam vyšetrení